様々な要因が考えられますが、以下の内容をご確認ください。
【Windowsの制限】
・お使いの Windows が旧バージョン（= Windows 10, 1703以前）の場合
ファイルの「フルパス」の長さが260文字を超えると同期できません。移行元・移行先ともに「フルパス」が260文字以下であることをご確認ください。
【フォルダ名の制限】
・Boxにアップロードできない文字がフォルダ名に含まれている可能性があります。（UTF-8以外の文字はアップロードできません。）
\、/、"、<、>、* などの特殊文字がフォルダ名に使用されていないかご確認ください。
【その他の制限】
・ ファイルサーバ上で排他制御がかかりエラーとなった可能性があります。その場合、転送がされなかったファイルは、再度同期を実行すると、差分ファイルのみがアップロードされます。再度お試しください。"